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| ★qsubコマンドでのジョブ投入方法やqsubコマンドの主なオプションを記載する | <=★ qsubコマンドでのジョブ投入方法やqsubコマンドの主なオプションを記載する |
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| #PBS -q rchq #PBS -l nodes=1:ppn=16 |
#PBS -q wSrchq #PBS -l nodes=1:ppn=28 |
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| * ジョブの投入先（eduq, rchq）はスクリプト内でも指定できます． | * ジョブの投入先（wSrchq）はスクリプト内でも指定できます． |
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| #PBS -q rchq #PBS -l nodes=1:ppn=16 |
#PBS -q wSrchq #PBS -l nodes=1:ppn=28 |
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| * ジョブの投入先（eduq, rchq）はスクリプト内でも指定できます． | * ジョブの投入先（wSrchq）はスクリプト内でも指定できます． |
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| #PBS -q eduq cd $PBS_O_WORKDIR |
#PBS -q wSrchq cd $PBS_O_WORKDIR |
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| #PBS -q eduq | #PBS -q wSrchq |
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| #PBS -q eduq | #PBS -q wSrchq |
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| #PBS -q eduq | #PBS -q wSrchq |
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| #PBS -q eduq | #PBS -q wSrchq |
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| #PBS -q eduq | #PBS -q wSrchq |
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| #PBS -q eduq | #PBS -q wSrchq |
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| <=★ 実行方法を確認後、記載する | |
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| ==== シングルジョブ ==== 以下に，実行スクリプト例を示します． {{{ ### sample #!/bin/sh #PBS -l nodes=1:ppn=1 #PBS -q eduq |
==== シングルジョブ ==== 以下に，実行スクリプト例を示します． {{{ ### sample #!/bin/sh #PBS -l nodes=1:ppn=1 #PBS -q wSrchq |
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| #PBS -q eduq | #PBS -q wSrchq |
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| === Patranジョブ === |
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| === ジョブ投入方法 === <=★ qsubコマンドでのジョブ投入方法やqsubコマンドの主なオプションを記載する === GaussView === 以下のコマンドを実行します． {{{ $ gview }}} 画面が起動します． === Patran === 以下のコマンドを実行します． {{{ $ patran }}} 画面が起動します． |
ジョブの実行
パッチジョブ
ジョブ投入方法
<=★ qsubコマンドでのジョブ投入方法やqsubコマンドの主なオプションを記載する
サンプルスクリプト：Intel MPI - Intelコンパイラを使用する場合
### sample
#!/bin/sh
#PBS -q wSrchq
#PBS -l nodes=1:ppn=28
MPI_PROCS=`wc -l $PBS_NODEFILE | awk '{print $1}'`
cd $PBS_O_WORKDIR
mpirun -np $MPI_PROCS ./a.out* ジョブの投入先（wSrchq）はスクリプト内でも指定できます．
サンプルスクリプト：OpenMPI - Intelコンパイラを使用する場合
### sample
#!/bin/sh
#PBS -q wSrchq
#PBS -l nodes=1:ppn=28
MPI_PROCS=`wc -l $PBS_NODEFILE | awk '{print $1}'`
module unload intelmpi.intel
module load openmpi.intel
cd $PBS_O_WORKDIR
mpirun -np $MPI_PROCS ./a.out* ジョブの投入先（wSrchq）はスクリプト内でも指定できます．
サンプルスクリプト：GPGPUプログラムを利用する場合
### sample #!/bin/sh #PBS -l nodes=1:GPU:ppn=1 #PBS -q wSrchq cd $PBS_O_WORKDIR module load cuda-5.0 ./a.out
ANSYS Multiphysicsジョブ
シングルジョブ
以下に，実行スクリプト例を示します．
### sample #!/bin/sh #PBS -l nodes=1:ppn=1 #PBS -q wSrchq module load ansys14.5 cd $PBS_O_WORKDIR ansys145 -b nolist -p AA_T_A -i vm1.dat -o vm1.out -j vm1
*vm1.datは/common/ansys14.5/ansys_inc/v145/ansys/data/verifにあります．
並列ジョブ
以下に，実行スクリプト例を示します．
例：Shared Memory ANSYSを用いる場合
### sample #!/bin/sh #PBS -l nodes=1:ppn=4 #PBS -q wSrchq module load ansys14.5 cd $PBS_O_WORKDIR ansys145 -b nolist -p AA_T_A -i vm141.dat -o vm141.out -j vm141 -np 4
例：Distributed ANSYSを用いる場合
### sample #!/bin/sh #PBS -l nodes=2:ppn=2 #PBS -q wSrchq module load ansys14.5 cd $PBS_O_WORKDIR ansys145 -b nolist -p AA_T_A -i vm141.dat -o vm141.out -j vm141 -np 4 -dis
*vm141.datは/common/ansys14.5/ansys_inc/v145/ansys/data/verifにあります．
ANSYS HFSSジョブ
ANSYS HFSS利用マニュアルに利用方法の詳細が説明されています。 そちらをご参照下さい。
ANSYS CFXジョブ
シングルジョブ
以下に，実行スクリプト例を示します．
### sample #!/bin/sh #PBS -l nodes=1:ppn=1 #PBS -q wSrchq module load ansys14.5 cd $PBS_O_WORKDIR cfx5solve -def StaticMixer.def
*StaticMixer.defは/common/ansys14.5/ansys_inc/v145/CFX/examplesにあります．
並列ジョブ
以下に，実行スクリプト例を示します．
### sample #!/bin/sh #PBS -l nodes=1:ppn=4 #PBS -q wSrchq module load ansys14.5 cd $PBS_O_WORKDIR cfx5solve -def StaticMixer.def -part 4 -start-method 'Intel MPI Local Parallel'
*StaticMixer.defは/common/ansys14.5/ansys_inc/v145/CFX/examplesにあります．
ABAQUSジョブ
シングルジョブ
以下に，実行スクリプト例を示します．
### sample #!/bin/sh #PBS -l nodes=1:ppn=1 #PBS -q wSrchq module load abaqus-6.12-3 cd $PBS_O_WORKDIR abaqus job=1_mass_coarse
*1_mass_coarse.inpは/common/abaqus-6.12-3/6.12-3/samples/job_archive/samples.zipにあります．
COMSOL Multiphysicsジョブ
<=★ 実行方法を確認後、記載する
GAUSSIANジョブ
サンプル入力ファイル(methane.com)
%NoSave %Mem=512MB %NProcShared=4 %chk=methane.chk #MP2/6-31G opt methane 0 1 C -0.01350511 0.30137653 0.27071342 H 0.34314932 -0.70743347 0.27071342 H 0.34316773 0.80577472 1.14436492 H 0.34316773 0.80577472 -0.60293809 H -1.08350511 0.30138971 0.27071342
シングルジョブ
以下に，実行スクリプト例を示します．
### sample #!/bin/sh #PBS -l nodes=1:ppn=1 #PBS -q wSrchq module load gaussian09-C.01 cd $PBS_O_WORKDIR g09 methane.com
並列ジョブ
以下に，実行スクリプト例を示します．
### sample #!/bin/sh #PBS -l nodes=1:ppn=4,mem=3gb,pvmem=3gb #PBS -q wSrchq cd $PBS_O_WORKDIR module load gaussian09-C.01 g09 methane.com
インタラクティブジョブ
ジョブ投入方法
<=★ qsubコマンドでのジョブ投入方法やqsubコマンドの主なオプションを記載する
GaussView
以下のコマンドを実行します．
$ gview
画面が起動します．
Patran
以下のコマンドを実行します．
$ patran
画面が起動します．
コンテナイメージの指定
利用リソースの指定