Singularityイメージファイルの入手
Singularityイメージファイル(sif)をホームディレクトリ(~)以下に置き,HPCクラスタのバッチジョブやインタラクティブジョブで指定することができます.
各ユーザの環境にてsingularity pullを利用することで,公開されているDockerイメージを変換してsifを入手できます.公開されているDockerイメージは Docker Hub や NVIDIA NGC などで検索できます.
例:NWChem(量子化学計算ソフトウェア)のDockerイメージをsifに変換
$ singularity pull docker://openchemistry/nwchem
例:NVIDIA NGCのPytorch Dockerイメージをsifに変換
$ nohup singularity pull docker://nvcr.io/nvidia/pytorch:22.12-py3 &
例:ROCmのTensorflow Dockerイメージをsifに変換
$ nohup singularity pull docker://rocm/tensorflow &
例:ROCmのPyTorch Dockerイメージをsifに変換 $ nohup singularity pull docker://rocm/pytorch:latest &