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| = 深層学習コンテナを利用する方法 = | = Singularityイメージファイルについて = |
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| singularity pullを利用することで，sifイメージのダウンロードやDockerイメージのsifファイルへの変換が可能です． ここでは深層学習用コンテナを利用する例として，Dockerイメージのsifファイルへの変換例を示します．キャッシュや一時ファイルを/work/[ユーザID]領域以下に生成するように環境変数を設定しています．これらがない場合，/home容量のオーバーやディレクトリのアクセス権限によるエラーとなります． |
Singularityイメージファイル（sif）をホームディレクトリ(~)以下に置き，HPCクラスタのバッチジョブやインタラクティブジョブで指定することができます． |
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| 各ユーザの環境にてsingularity pullを利用することで，sifのダウンロードやDockerイメージのsifへの変換が可能です．公開されているDockerイメージは https://hub.docker.com/ にて検索できます． 例：NWChem（量子化学計算ソフトウェア）のDockerイメージをsifに変換 {{{ $ singularity pull docker://openchemistry/nwchem }}} 例：NVIDIA NGCのPytorch Dockerイメージをsifに変換 {{{ $ nohup singularity pull docker://nvcr.io/nvidia/pytorch:22.12-py3 & }}} {{{#!wiki comment |
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| {{{ $ export SINGULARITY_CACHEDIR=/work/yi041 $ export SINGULARITY_TMPDIR=/work/yi041 |
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例：NGCのPytorch Dockerイメージをsifに変換 {{{ $ export SINGULARITY_CACHEDIR=/work/yi041 $ export SINGULARITY_TMPDIR=/work/yi041 $ nohup singularity pull docker://nvcr.io/nvidia/pytorch:22.12-py3 & }}} |
Singularityイメージファイルについて
Singularityイメージファイル（sif）をホームディレクトリ(~)以下に置き，HPCクラスタのバッチジョブやインタラクティブジョブで指定することができます．
各ユーザの環境にてsingularity pullを利用することで，sifのダウンロードやDockerイメージのsifへの変換が可能です．公開されているDockerイメージは https://hub.docker.com/ にて検索できます．
例：NWChem（量子化学計算ソフトウェア）のDockerイメージをsifに変換
$ singularity pull docker://openchemistry/nwchem
例：NVIDIA NGCのPytorch Dockerイメージをsifに変換
$ nohup singularity pull docker://nvcr.io/nvidia/pytorch:22.12-py3 &