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2019-09-18 06:20:45時点のリビジョン7
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編集者: hitachi28
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編集者: hitachi28
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module load intelmpi.intel module load intelmpi.intel-4.0.1
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module load openmpi.intel module load openmpi.intel-4.0.1

プログラムのコンパイル

Intel コンパイラ

C/C++ で記述された計算プログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述された計算プログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ ifort ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

PGI コンパイラ(準備中)

C/C++ で記述された計算プログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ pgcc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述された計算プログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ pgf90 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

$ pgf77 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

GNU コンパイラ

C/C++ で記述された計算プログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ gcc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran コンパイラ

Fortran で記述された計算プログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ gfortran ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Intel MPI

C/C++ で記述された計算プログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ mpiicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述された計算プログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ mpiifort ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

(例)
Fortran で記述された計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルする場合の実行スクリプト

### sample
#!/bin/sh
#PBS -q gSrchq
#PBS -l select=1:ncpus=4:host=xsnd01
#PBS -v DOCKER_IMAGE=prg-env:2019.08

source /etc/profile

module load intel
module load intelmpi.intel-4.0.1 

cd $PBS_O_WORKDIR

mpiifort sample.f -o sample.out

* ジョブの投入方法は,ジョブの実行 を参照して下さい.

Open MPI

C/C++ で記述された計算プログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ mpicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述された計算プログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ mpif90 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

$ mpif77 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

(例)
Fortran で記述された計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルする場合の実行スクリプト

### sample
#!/bin/sh
#PBS -q gSrchq
#PBS -l select=1:ncpus=4:host=xsnd01
#PBS -v DOCKER_IMAGE=prg-env:2019.08

source /etc/profile

module load intel
module load openmpi.intel-4.0.1

cd $PBS_O_WORKDIR

mpif90 sample.f -o sample.out

* ジョブの投入方法は,ジョブの実行 を参照して下さい.