3と31のリビジョン間の差分 (その間の編集: 28回)

プログラムのコンパイル

GNU コンパイラ

窓口サーバで利用できます． C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ gcc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ g++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ gfortran ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Intel コンパイラ

窓口サーバで利用できます．コンパイルを行う前に，moduleコマンドを実行してください．

$ module load intel/2025

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

AMD コンパイラ (AOCC)

窓口サーバで利用できます．コンパイルを行う前に，moduleコマンドを実行してください．

$ module load aocc/5.0.0

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ clang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ clang++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ flang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Intel MPI

窓口サーバで利用できます．コンパイルを行う前に，moduleコマンドを実行してください．

$ module load intelmpi/2025

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ mpiicc -cc=icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ mpiicpc -cxx=icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ mpiifort -fc=ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

(例) C で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト

#PBS -q Eduq
#PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4 

ulimit -c 0             # avoid generating core files
. /etc/profile          # enable module command
module load intel/2025
module load intelmpi/2025

cd $PBS_O_WORKDIR
mpiicc -cc=icx test.c -o test.x
mpirun -np 4 ./test.x

Open MPI

窓口サーバで利用できます．コンパイルを行う前に，moduleコマンドを実行してください．

$ module load openmpi5.04

Open MPIを使用する場合は，コンパイラのコマンドを環境変数で指定します．ここではGNUコンパイラの場合を示します． C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ export OMPI_CC=gcc
$ mpicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ export OMPI_CXX=g++
$ mpicxx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ export OMPI_FC=gfortran
$ mpif90 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

$ export OMPI_F77=gfortran
$ mpif77 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

(例) Fortran で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト

#PBS -q Eduq
#PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4

ulimit -c 0             # avoid generating core files
. /etc/profile          # enable module command
module load intel/2025
module load openmpi5.04

cd $PBS_O_WORKDIR

mpiifort -fc=ifx test.f90 -o test.x

ROCm環境のコンパイル

計算サーバのAMD GPUを利用するためのコンパイルコマンドです．事前にインタラクティブジョブにより計算サーバに移動してください．

$ qsub -I -q Eduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_amd_2025.01.sif

C言語もしくはC++で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ hipcc -I/opt/rocm/include -D__HIP_PLATFORM_AMD__ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

* インタラクティブジョブの詳細については，ジョブの実行を参照して下さい．

CUDAを利用する場合のコンパイル

CUDAによりIoT・AI基盤システムのNVIDIA GPUを利用するためのコンパイルコマンドです．事前にインタラクティブジョブによりIoT・AI基盤システムの計算サーバに移動してください．

$ qsub -I -q iEduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_intel_2025.01.sif

C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ nvcc -ccbin gcc -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ nvcc -ccbin g++ -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortranで記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ nvfortran -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

* インタラクティブジョブの詳細については，ジョブの実行を参照して下さい．

-  ⇤ ← 2019-08-23 01:10:43時点のリビジョン3 → 
  サイズ: 2446
  編集者: hitachi28
  コメント:
+   ← 2025-06-09 05:05:08時点のリビジョン31 → ⇥
  サイズ: 7315
  編集者: hitachi26
  コメント:
-削除された箇所はこのように表示されます。
+追加された箇所はこのように表示されます。
 行 2:
-=== Intel コンパイラ ===
C/C++ で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

{{{
$ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
Fortran で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

{{{
$ ifort ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
=== PGI コンパイラ ===
C/C++ で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

{{{
$ pgcc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
Fortran で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

{{{
$ pgf90 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
{{{
$ pgf77 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
=== GNU コンパイラ ===
C/C++ で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+== GNU コンパイラ ==
窓口サーバで利用できます．
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 33:
+行 8:
-=== Fortranコンパイラ ===
Fortran で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 36:
+行 9:
+C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ g++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 39:
+行 18:
-=== Intel MPI ===
C/C++ で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+== Intel コンパイラ ==
窓口サーバで利用できます．コンパイルを行う前に，moduleコマンドを実行してください．
{{{
$ module load intel/2025
}}}

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

== AMD コンパイラ (AOCC) ==
窓口サーバで利用できます．コンパイルを行う前に，moduleコマンドを実行してください．
{{{
$ module load aocc/5.0.0
}}}

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ clang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ clang++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ flang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

== Intel MPI ==
窓口サーバで利用できます．コンパイルを行う前に，moduleコマンドを実行してください．
{{{
$ module load intelmpi/2025
}}}

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ mpiicc -cc=icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ mpiicpc -cxx=icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 43:
+行 79:
-$ mpiicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
+$ mpiifort -fc=ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
-行 45:
+行 81:
-Fortran で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 47:
+行 82:
+(例)
C で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト
-行 48:
+行 85:
-$ mpiifort ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
+#!/bin/bash
#PBS -q Eduq
#PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4 

ulimit -c 0		# avoid generating core files
. /etc/profile		# enable module command
module load intel/2025
module load intelmpi/2025

cd $PBS_O_WORKDIR
mpiicc -cc=icx test.c -o test.x
mpirun -np 4 ./test.x
-行 50:
+行 99:
-=== OpenMPI ===
C/C++ で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+== Open MPI ==
窓口サーバで利用できます．コンパイルを行う前に，moduleコマンドを実行してください．
{{{
$ module load openmpi5.04
}}}
-行 53:
+行 105:
+Open MPIを使用する場合は，コンパイラのコマンドを環境変数で指定します．ここではGNUコンパイラの場合を示します．
C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 54:
+行 108:
+$ export OMPI_CC=gcc
-行 56:
+行 111:
-Fortran で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 58:
+行 112:
+C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 59:
+行 114:
+$ export OMPI_CXX=g++
$ mpicxx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ export OMPI_FC=gfortran
-行 62:
+行 124:
+$ export OMPI_F77=gfortran
-行 64:
+行 127:
+(例)
Fortran で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト

{{{
#!/bin/bash
#PBS -q Eduq
#PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4

ulimit -c 0		# avoid generating core files
. /etc/profile		# enable module command
module load intel/2025
module load openmpi5.04

cd $PBS_O_WORKDIR

mpiifort -fc=ifx test.f90 -o test.x

}}}


== ROCm環境のコンパイル ==
計算サーバのAMD GPUを利用するためのコンパイルコマンドです．
事前にインタラクティブジョブにより計算サーバに移動してください．
{{{
$ qsub -I -q Eduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_amd_2025.01.sif
}}}

C言語もしくはC++で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ hipcc -I/opt/rocm/include -D__HIP_PLATFORM_AMD__ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

* インタラクティブジョブの詳細については，[[https://hpcportal.imc.tut.ac.jp/wiki/HowToSubmitJob|ジョブの実行]] を参照して下さい．

== CUDAを利用する場合のコンパイル ==
CUDAによりIoT・AI基盤システムのNVIDIA GPUを利用するためのコンパイルコマンドです．
事前にインタラクティブジョブによりIoT・AI基盤システムの計算サーバに移動してください．
{{{
$ qsub -I -q iEduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_intel_2025.01.sif
}}}

C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ nvcc -ccbin gcc -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

C++で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ nvcc -ccbin g++ -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

Fortranで記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ nvfortran -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

* インタラクティブジョブの詳細については，[[https://hpcportal.imc.tut.ac.jp/wiki/HowToSubmitJob|ジョブの実行]] を参照して下さい．