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| == GNU コンパイラ (GCC) == 窓口サーバで利用できます． C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． {{{ $ gcc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． {{{ $ g++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． {{{ $ gfortran ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} |
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| C で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． | 窓口サーバで利用できます．コンパイルを行う前に，moduleコマンドを実行してください． {{{ $ module load intel/2025 }}} |
| 行 5: | 行 25: |
| C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． {{{ $ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． |
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| {{{ $ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． |
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| {{{ $ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} {{{ $ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． |
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． |
| 行 24: | 行 39: |
== AMD コンパイラ (AOCC) == 窓口サーバで利用できます．コンパイルを行う前に，moduleコマンドを実行してください． |
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| 行 25: | 行 43: |
| $ ifort ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 | $ module load aocc/5.0.0 |
| 行 27: | 行 45: |
| == GNU コンパイラ == C で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． |
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| 行 30: | 行 46: |
| C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． | |
| 行 31: | 行 48: |
| $ gcc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 | $ clang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 |
| 行 33: | 行 50: |
| C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． | |
| 行 35: | 行 51: |
| C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． | |
| 行 36: | 行 53: |
| $ g++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 | $ clang++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 |
| 行 38: | 行 55: |
| Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． | |
| 行 40: | 行 56: |
| Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． | |
| 行 41: | 行 58: |
| $ gfortran ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 | $ flang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 |
| 行 43: | 行 60: |
| 行 44: | 行 62: |
| C で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． | 窓口サーバで利用できます．コンパイルを行う前に，moduleコマンドを実行してください． {{{ $ module load intelmpi/2025 }}} |
| 行 46: | 行 67: |
| C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． | |
| 行 49: | 行 71: |
| C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． | |
| 行 51: | 行 72: |
| C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． | |
| 行 54: | 行 76: |
| Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． | Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． |
| 行 59: | 行 81: |
| (例)<<BR>>C で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト | |
| 行 61: | 行 82: |
| == Open MPI == 窓口サーバで利用できます．コンパイルを行う前に，moduleコマンドを実行してください． |
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| 行 62: | 行 85: |
| #!/bin/bash #PBS -q wEduq #PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4 #PBS -v DOCKER_IMAGE=mpi-env:latest,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw" ulimit -c 0 # avoid generating core files source /etc/profile # enable module command . /common/intel-2022/compiler/latest/env/vars.sh # Intel compiler . /common/intel-2022/mpi/latest/env/vars.sh # Intel MPI . /common/intel-2022/mkl/latest/env/vars.sh # Intel MKL cd $PBS_O_WORKDIR mpiicc -cc=icx test.c -o test.x mpirun -np 4 ./test.x |
$ module load openmpi5.04 |
| 行 79: | 行 88: |
| * ジョブの投入方法は，[[https://hpcportal.imc.tut.ac.jp/wiki/HowToSubmitJob|ジョブの実行]] を参照して下さい． == Open MPI == C で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． |
Open MPIを使用する場合は，コンパイラのコマンドを環境変数で指定します．ここではGNUコンパイラの場合を示します． C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． |
| 行 85: | 行 91: |
| $ export OMPI_CC=gcc | |
| 行 87: | 行 94: |
| C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． | |
| 行 89: | 行 95: |
| C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． | |
| 行 90: | 行 97: |
| $ mpicpc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 | $ export OMPI_CXX=g++ $ mpicxx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 |
| 行 92: | 行 100: |
| Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． | |
| 行 94: | 行 101: |
| Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． | |
| 行 95: | 行 103: |
| $ export OMPI_FC=gfortran | |
| 行 98: | 行 107: |
| $ export OMPI_F77=gfortran | |
| 行 100: | 行 110: |
| (例)<<BR>>Fortran で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト | |
| 行 102: | 行 111: |
| == ROCm環境のコンパイル == 計算サーバのAMD GPUを利用するためのコンパイルコマンドです． 事前にインタラクティブジョブにより計算サーバに移動してください． |
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| 行 103: | 行 115: |
| #!/bin/bash #PBS -q wEduq #PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4 #PBS -v DOCKER_IMAGE=mpi-env:latest,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw" ulimit -c 0 # avoid generating core files source /etc/profile # enable module command . /common/intel-2022/compiler/latest/env/vars.sh # Intel compiler . /common/intel-2022/mpi/latest/env/vars.sh # Intel MPI . /common/intel-2022/mkl/latest/env/vars.sh # Intel MKL cd $PBS_O_WORKDIR mpiifort -fc=ifx test.f90 -o test.x mpirun -np 4 ./test.x |
$ qsub -I -q Eduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_amd_2025.01.sif |
| 行 120: | 行 118: |
| * ジョブの投入方法は，[[https://hpcportal.imc.tut.ac.jp/wiki/HowToSubmitJob|ジョブの実行]] を参照して下さい． | C言語もしくはC++で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． {{{ $ hipcc -I/opt/rocm/include -D__HIP_PLATFORM_AMD__ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} * インタラクティブジョブの詳細については，[[https://hpcportal.imc.tut.ac.jp/wiki/HowToSubmitJob|ジョブの実行]] を参照して下さい． == CUDAを利用する場合のコンパイル == CUDAによりIoT・AI基盤システムのNVIDIA GPUを利用するためのコンパイルコマンドです． 事前にインタラクティブジョブによりIoT・AI基盤システムの計算サーバに移動してください． {{{ $ qsub -I -q iEduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_intel_2025.01.sif }}} C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． {{{ $ nvcc -ccbin gcc -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} C++で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． {{{ $ nvcc -ccbin g++ -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} Fortranで記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． {{{ $ nvfortran -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} * インタラクティブジョブの詳細については，[[https://hpcportal.imc.tut.ac.jp/wiki/HowToSubmitJob|ジョブの実行]] を参照して下さい． |
プログラムのコンパイル
GNU コンパイラ (GCC)
窓口サーバで利用できます． C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
$ gcc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
$ g++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
$ gfortran ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Intel コンパイラ
窓口サーバで利用できます．コンパイルを行う前に，moduleコマンドを実行してください．
$ module load intel/2025
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
$ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
$ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
$ ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
AMD コンパイラ (AOCC)
窓口サーバで利用できます．コンパイルを行う前に，moduleコマンドを実行してください．
$ module load aocc/5.0.0
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
$ clang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
$ clang++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
$ flang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Intel MPI
窓口サーバで利用できます．コンパイルを行う前に，moduleコマンドを実行してください．
$ module load intelmpi/2025
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
$ mpiicc -cc=icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
$ mpiicpc -cxx=icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
$ mpiifort -fc=ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Open MPI
窓口サーバで利用できます．コンパイルを行う前に，moduleコマンドを実行してください．
$ module load openmpi5.04
Open MPIを使用する場合は，コンパイラのコマンドを環境変数で指定します．ここではGNUコンパイラの場合を示します． C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
$ export OMPI_CC=gcc $ mpicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
$ export OMPI_CXX=g++ $ mpicxx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
$ export OMPI_FC=gfortran $ mpif90 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
$ export OMPI_F77=gfortran $ mpif77 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
ROCm環境のコンパイル
計算サーバのAMD GPUを利用するためのコンパイルコマンドです． 事前にインタラクティブジョブにより計算サーバに移動してください．
$ qsub -I -q Eduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_amd_2025.01.sif
C言語もしくはC++で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
$ hipcc -I/opt/rocm/include -D__HIP_PLATFORM_AMD__ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
* インタラクティブジョブの詳細については，ジョブの実行 を参照して下さい．
CUDAを利用する場合のコンパイル
CUDAによりIoT・AI基盤システムのNVIDIA GPUを利用するためのコンパイルコマンドです． 事前にインタラクティブジョブによりIoT・AI基盤システムの計算サーバに移動してください．
$ qsub -I -q iEduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_intel_2025.01.sif
C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
$ nvcc -ccbin gcc -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
$ nvcc -ccbin g++ -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortranで記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
$ nvfortran -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
* インタラクティブジョブの詳細については，ジョブの実行 を参照して下さい．