21と27のリビジョン間の差分 (その間の編集: 6回)

プログラムのコンパイル

Intel コンパイラ

窓口サーバで利用できます．コンパイルを行う前に，moduleコマンドを実行してください．

$ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

GNU コンパイラ

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ gcc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ g++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ gfortran ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

AMD コンパイラ (AOCC)

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ clang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ clang++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ flang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Intel MPI (Intel コンパイラとの組み合わせ)

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ mpiicc -cc=icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ mpiicpc -cxx=icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ mpiifort -fc=ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Open MPI

Open MPIを使用する場合は，コンパイラのコマンドを環境変数で指定します．ここではGNUコンパイラの場合を示します． C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ export OMPI_CC=gcc
$ mpicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ export OMPI_CXX=g++
$ mpicxx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ export OMPI_FC=gfortran
$ mpif90 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

$ export OMPI_F77=gfortran
$ mpif77 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

ROCm環境のコンパイル

計算サーバのAMD GPUを利用するためのコンパイルコマンドです．事前にインタラクティブジョブにより計算サーバに移動してください．

$ qsub -I -q Eduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_amd_2025.01.sif

C言語もしくはC++で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ hipcc -I/opt/rocm/include -D__HIP_PLATFORM_AMD__ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

CUDAを利用する場合のコンパイル

CUDAによりIoT・AI基盤システムのNVIDIA GPUを利用するためのコンパイルコマンドです．事前にインタラクティブジョブによりIoT・AI基盤システムの計算サーバに移動してください．

$ qsub -I -q iEduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_intel_2025.01.sif

C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ nvcc -ccbin gcc -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ nvcc -ccbin g++ -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortranで記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ nvfortran -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

* インタラクティブジョブの詳細については，ジョブの実行を参照して下さい．

-  ⇤ ← 2024-05-02 06:31:56時点のリビジョン21 → 
  サイズ: 4602
  編集者: yi041
  コメント:
+   ← 2025-06-09 03:12:09時点のリビジョン27 → ⇥
  サイズ: 5777
  編集者: yi041
  コメント:
-削除された箇所はこのように表示されます。
+追加された箇所はこのように表示されます。
 行 3:
-C で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+窓口サーバで利用できます．コンパイルを行う前に，moduleコマンドを実行してください．
{{{
$ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
-行 5:
+行 8:
+C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 8:
+行 17:
-{{{
$ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 13:
+行 18:
-{{{
$ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
{{{
$ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 24:
+行 22:
-{{{
$ ifort ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
-行 28:
+行 24:
-C で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 33:
+行 28:
-C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 35:
+行 29:
+C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 38:
+行 33:
-Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 40:
+行 34:
+Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 43:
+行 38:
-== Intel MPI ==
C で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 46:
+行 39:
+== AMD コンパイラ (AOCC) ==
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ clang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ clang++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ flang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

== Intel MPI (Intel コンパイラとの組み合わせ) ==
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 49:
+行 60:
-C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 51:
+行 61:
+C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 54:
+行 65:
-Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 59:
+行 70:
-(例)<<BR>>C で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト
-行 61:
+行 71:
+== Open MPI ==
Open MPIを使用する場合は，コンパイラのコマンドを環境変数で指定します．ここではGNUコンパイラの場合を示します．
C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 62:
+行 75:
-#!/bin/bash
#PBS -q wEduq
#PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4
#PBS -v DOCKER_IMAGE=mpi-env:latest,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw"

ulimit -c 0          # avoid generating core files
source /etc/profile  # enable module command
. /common/intel-2022/compiler/latest/env/vars.sh  # Intel compiler
. /common/intel-2022/mpi/latest/env/vars.sh       # Intel MPI
. /common/intel-2022/mkl/latest/env/vars.sh       # Intel MKL

cd $PBS_O_WORKDIR

mpiicc -cc=icx test.c -o test.x
mpirun -np 4 ./test.x
+$ export OMPI_CC=gcc
$ mpicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
 行 79:
-* ジョブの投入方法は，[[https://hpcportal.imc.tut.ac.jp/wiki/HowToSubmitJob|ジョブの実行]] を参照して下さい．
+C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ export OMPI_CXX=g++
$ mpicxx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
-行 81:
+行 85:
-== Open MPI ==
C で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 85:
+行 87:
-$ mpicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

{{{
$ mpicpc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

{{{
+$ export OMPI_FC=gfortran
-行 98:
+行 91:
+$ export OMPI_F77=gfortran
-行 100:
+行 94:
-(例)<<BR>>Fortran で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト
-行 102:
+行 95:
+== ROCm環境のコンパイル ==
計算サーバのAMD GPUを利用するためのコンパイルコマンドです．
事前にインタラクティブジョブにより計算サーバに移動してください．
-行 103:
+行 99:
-#!/bin/bash
#PBS -q wEduq
#PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4
#PBS -v DOCKER_IMAGE=mpi-env:latest,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw"

ulimit -c 0          # avoid generating core files
source /etc/profile  # enable module command
. /common/intel-2022/compiler/latest/env/vars.sh  # Intel compiler
. /common/intel-2022/mpi/latest/env/vars.sh       # Intel MPI
. /common/intel-2022/mkl/latest/env/vars.sh       # Intel MKL

cd $PBS_O_WORKDIR

mpiifort -fc=ifx test.f90 -o test.x
mpirun -np 4 ./test.x
+$ qsub -I -q Eduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_amd_2025.01.sif
-行 120:
+行 102:
-* ジョブの投入方法は，[[https://hpcportal.imc.tut.ac.jp/wiki/HowToSubmitJob|ジョブの実行]] を参照して下さい．
+C言語もしくはC++で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ hipcc -I/opt/rocm/include -D__HIP_PLATFORM_AMD__ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

== CUDAを利用する場合のコンパイル ==
CUDAによりIoT・AI基盤システムのNVIDIA GPUを利用するためのコンパイルコマンドです．
事前にインタラクティブジョブによりIoT・AI基盤システムの計算サーバに移動してください．
{{{
$ qsub -I -q iEduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_intel_2025.01.sif
}}}

C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ nvcc -ccbin gcc -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

C++で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ nvcc -ccbin g++ -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

Fortranで記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ nvfortran -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

* インタラクティブジョブの詳細については，[[https://hpcportal.imc.tut.ac.jp/wiki/HowToSubmitJob|ジョブの実行]] を参照して下さい．