21と26のリビジョン間の差分 (その間の編集: 5回)

プログラムのコンパイル

Intel コンパイラ

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

GNU コンパイラ

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ gcc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ g++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ gfortran ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

AMD コンパイラ (AOCC)

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ clang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ clang++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ flang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Intel MPI (Intel コンパイラとの組み合わせ)

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ mpiicc -cc=icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ mpiicpc -cxx=icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ mpiifort -fc=ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Open MPI

Open MPIを使用する場合は，コンパイラのコマンドを環境変数で指定します．ここではGNUコンパイラの場合を示します． C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ export OMPI_CC=gcc
$ mpicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ export OMPI_CXX=g++
$ mpicxx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ export OMPI_FC=gfortran
$ mpif90 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

$ export OMPI_F77=gfortran
$ mpif77 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

ROCm環境のコンパイル

計算サーバのAMD GPUを利用するためのコンパイルコマンドです．事前にインタラクティブジョブにより計算サーバに移動してください．

$ qsub -I -q Eduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_amd_2025.01.sif

C言語もしくはC++で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ hipcc -I/opt/rocm/include -D__HIP_PLATFORM_AMD__ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

NVIDIA HPCコンパイラ

IoT・AI基盤システムのNVIDIA GPUを利用するためのコンパイルコマンドです．事前にインタラクティブジョブによりIoT・AI基盤システムの計算サーバに移動してください．

$ qsub -I -q iEduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_intel_2025.01.sif

C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ nvcc -ccbin gcc -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortranで記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ nvfortran -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

* ジョブの投入方法は，ジョブの実行を参照して下さい．

-  ⇤ ← 2024-05-02 06:31:56時点のリビジョン21 → 
  サイズ: 4602
  編集者: yi041
  コメント:
+   ← 2025-06-09 02:58:08時点のリビジョン26 → ⇥
  サイズ: 5238
  編集者: yi041
  コメント:
-削除された箇所はこのように表示されます。
+追加された箇所はこのように表示されます。
 行 3:
-C で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
{{{
$ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
-行 5:
+行 8:
+C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 8:
+行 12:
-{{{
$ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
 行 13:
-{{{
$ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
{{{
$ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
-行 20:
+行 14:
-行 24:
+行 17:
-{{{
$ ifort ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
-行 28:
+行 19:
-C で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 33:
+行 23:
-行 34:
+行 25:
-行 38:
+行 28:
-行 39:
+行 30:
-行 43:
+行 33:
-== Intel MPI ==
C で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 46:
+行 34:
+== AMD コンパイラ (AOCC) ==
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
{{{
$ clang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
{{{
$ clang++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
{{{
$ flang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

== Intel MPI (Intel コンパイラとの組み合わせ) ==
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 49:
+行 55:
-行 50:
+行 57:
-行 59:
+行 65:
-(例)<<BR>>C で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト
-行 61:
+行 66:
+== Open MPI ==
Open MPIを使用する場合は，コンパイラのコマンドを環境変数で指定します．ここではGNUコンパイラの場合を示します．
C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 62:
+行 70:
-#!/bin/bash
#PBS -q wEduq
#PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4
#PBS -v DOCKER_IMAGE=mpi-env:latest,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw"
+$ export OMPI_CC=gcc
$ mpicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
-行 67:
+行 74:
-ulimit -c 0          # avoid generating core files
source /etc/profile  # enable module command
. /common/intel-2022/compiler/latest/env/vars.sh  # Intel compiler
. /common/intel-2022/mpi/latest/env/vars.sh       # Intel MPI
. /common/intel-2022/mkl/latest/env/vars.sh       # Intel MKL
+C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
{{{
$ export OMPI_CXX=g++
$ mpicxx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
-行 73:
+行 80:
-cd $PBS_O_WORKDIR
+Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
{{{
$ export OMPI_FC=gfortran
$ mpif90 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
{{{
$ export OMPI_F77=gfortran
$ mpif77 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
-行 75:
+行 90:
-mpiicc -cc=icx test.c -o test.x
mpirun -np 4 ./test.x
+== ROCm環境のコンパイル ==
計算サーバのAMD GPUを利用するためのコンパイルコマンドです．
事前にインタラクティブジョブにより計算サーバに移動してください．
{{{
$ qsub -I -q Eduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_amd_2025.01.sif
}}}

C言語もしくはC++で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
{{{
$ hipcc -I/opt/rocm/include -D__HIP_PLATFORM_AMD__ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

== NVIDIA HPCコンパイラ ==
IoT・AI基盤システムのNVIDIA GPUを利用するためのコンパイルコマンドです．
事前にインタラクティブジョブによりIoT・AI基盤システムの計算サーバに移動してください．
{{{
$ qsub -I -q iEduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_intel_2025.01.sif
}}}

C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
{{{
$ nvcc -ccbin gcc -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

Fortranで記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
{{{
$ nvfortran -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
-行 80:
+行 120:
-== Open MPI ==
C で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

{{{
$ mpicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

{{{
$ mpicpc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

{{{
$ mpif90 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
{{{
$ mpif77 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
(例)<<BR>>Fortran で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト

{{{
#!/bin/bash
#PBS -q wEduq
#PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4
#PBS -v DOCKER_IMAGE=mpi-env:latest,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw"

ulimit -c 0          # avoid generating core files
source /etc/profile  # enable module command
. /common/intel-2022/compiler/latest/env/vars.sh  # Intel compiler
. /common/intel-2022/mpi/latest/env/vars.sh       # Intel MPI
. /common/intel-2022/mkl/latest/env/vars.sh       # Intel MKL

cd $PBS_O_WORKDIR

mpiifort -fc=ifx test.f90 -o test.x
mpirun -np 4 ./test.x
}}}

* ジョブの投入方法は，[[https://hpcportal.imc.tut.ac.jp/wiki/HowToSubmitJob|ジョブの実行]] を参照して下さい．