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C で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. | C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. {{{ $ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} |
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C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. | |
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{{{ $ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. |
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{{{ $ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} {{{ $ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} |
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{{{ $ ifort ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} |
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行 28: | 行 19: |
C で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. |
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. |
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行 34: | 行 25: |
行 38: | 行 28: |
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行 43: | 行 33: |
== Intel MPI == C で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. |
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行 46: | 行 34: |
== AMD コンパイラ (AOCC) == C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. {{{ $ clang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. {{{ $ clang++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. {{{ $ flang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} == Intel MPI (Intel コンパイラとの組み合わせ) == C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. |
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行 49: | 行 55: |
行 50: | 行 57: |
行 63: | 行 69: |
#PBS -q wEduq #PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4 #PBS -v DOCKER_IMAGE=mpi-env:latest,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw" |
#PBS -q Eduq #PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4 |
行 67: | 行 72: |
ulimit -c 0 # avoid generating core files source /etc/profile # enable mocule command . /common/intel-2022/compiler/latest/env/vars.sh # Intel compiler . /common/intel-2022/mpi/latest/env/vars.sh # Intel MPI . /common/intel-2022/mkl/latest/env/vars.sh # Intel MKL |
ulimit -c 0 # avoid generating core files . /etc/profile # enable module command module load intel/2025 module load intelmpi/2025 |
行 74: | 行 78: |
行 82: | 行 85: |
C で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. |
Open MPIを使用する場合は,コンパイラのコマンドを環境変数で指定します.ここではGNUコンパイラの場合を示します. C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. |
行 85: | 行 88: |
$ export OMPI_CC=gcc | |
行 90: | 行 94: |
$ mpicpc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 | $ export OMPI_CXX=g++ $ mpicxx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 |
行 95: | 行 100: |
$ export OMPI_FC=gfortran | |
行 98: | 行 104: |
$ export OMPI_F77=gfortran | |
行 100: | 行 107: |
行 104: | 行 112: |
#PBS -q wEduq | #PBS -q Eduq |
行 106: | 行 114: |
#PBS -v DOCKER_IMAGE=mpi-env:latest,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw" | |
行 108: | 行 115: |
source /etc/profile module load intel module load openmpi.intel-4.0.1 |
ulimit -c 0 # avoid generating core files . /etc/profile # enable module command module load intel/2025 module load openmpi5.04 |
行 114: | 行 122: |
mpiif90 test.f90 -o test.x | mpiifort -fc=ifx test.f90 -o test.x |
プログラムのコンパイル
Intel コンパイラ
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
$ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
$ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
$ ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
GNU コンパイラ
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
$ gcc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
$ g++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
$ gfortran ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
AMD コンパイラ (AOCC)
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
$ clang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
$ clang++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
$ flang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Intel MPI (Intel コンパイラとの組み合わせ)
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
$ mpiicc -cc=icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
$ mpiicpc -cxx=icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
$ mpiifort -fc=ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
(例)
C で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし,4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト
#PBS -q Eduq #PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4 ulimit -c 0 # avoid generating core files . /etc/profile # enable module command module load intel/2025 module load intelmpi/2025 cd $PBS_O_WORKDIR mpiicc -cc=icx test.c -o test.x mpirun -np 4 ./test.x
* ジョブの投入方法は,ジョブの実行 を参照して下さい.
Open MPI
Open MPIを使用する場合は,コンパイラのコマンドを環境変数で指定します.ここではGNUコンパイラの場合を示します. C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
$ export OMPI_CC=gcc $ mpicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
$ export OMPI_CXX=g++ $ mpicxx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
$ export OMPI_FC=gfortran $ mpif90 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
$ export OMPI_F77=gfortran $ mpif77 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
(例)
Fortran で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし,4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト
#PBS -q Eduq #PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4 ulimit -c 0 # avoid generating core files . /etc/profile # enable module command module load intel/2025 module load openmpi5.04 cd $PBS_O_WORKDIR mpiifort -fc=ifx test.f90 -o test.x mpirun -np 4 ./test.x
* ジョブの投入方法は,ジョブの実行 を参照して下さい.