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2024-05-02 05:58:54時点のリビジョン20
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編集者: yi041
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2025-06-09 01:38:44時点のリビジョン25
サイズ: 4881
編集者: yi041
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行 3: 行 3:
C で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
{{{
$ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
行 5: 行 8:
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
行 8: 行 12:
{{{
$ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
行 13: 行 13:
{{{
$ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
{{{
$ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
行 20: 行 14:
行 24: 行 17:
{{{
$ ifort ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
行 28: 行 19:
C で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
行 33: 行 23:
行 34: 行 25:
行 38: 行 28:
行 39: 行 30:
行 43: 行 33:
== Intel MPI ==
C で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
行 46: 行 34:
== AMD コンパイラ (AOCC) ==
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
{{{
$ clang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
{{{
$ clang++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
{{{
$ flang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

== Intel MPI (Intel コンパイラとの組み合わせ) ==
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
行 49: 行 55:
行 50: 行 57:
行 63: 行 69:
#PBS -q wEduq
#PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4
#PBS
-v DOCKER_IMAGE=mpi-env:latest,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw"
#PBS -q Eduq
#PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4
行 67: 行 72:
ulimit -c 0          # avoid generating core files
source /etc/profile  # enable mocule command
. /common/intel-2022/compiler/latest/env/vars.sh  # Intel compiler
. /common/
intel-2022/mpi/latest/env/vars.sh # Intel MPI
. /common/intel-
2022/mkl/latest/env/vars.sh # Intel MKL
ulimit -c 0  # avoid generating core files
. /etc/profile  # enable module command
module load intel/2025
m
odule load intelmpi/2025
行 74: 行 78:
行 82: 行 85:
C で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
Open MPIを使用する場合は,コンパイラのコマンドを環境変数で指定します.ここではGNUコンパイラの場合を示します.
C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.
行 85: 行 88:
$ export OMPI_CC=gcc
行 90: 行 94:
$ mpicpc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 $ export OMPI_CXX=g++
$ mpicxx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
行 95: 行 100:
$ export OMPI_FC=gfortran
行 98: 行 104:
$ export OMPI_F77=gfortran
行 100: 行 107:
行 104: 行 112:
#PBS -q wEduq #PBS -q Eduq
行 106: 行 114:
#PBS -v DOCKER_IMAGE=mpi-env:latest,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw"
行 108: 行 115:
source /etc/profile
module load intel
module load openmpi.intel-4.0.1
ulimit -c 0 # avoid generating core files
.
/etc/profile  # enable module command
module load intel/2025
module load openmpi5.04
行 114: 行 122:
mpiif90 test.f90 -o test.x mpiifort -fc=ifx test.f90 -o test.x

プログラムのコンパイル

Intel コンパイラ

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.

$ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

GNU コンパイラ

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ gcc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ g++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ gfortran ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

AMD コンパイラ (AOCC)

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ clang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ clang++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ flang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Intel MPI (Intel コンパイラとの組み合わせ)

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ mpiicc -cc=icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ mpiicpc -cxx=icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ mpiifort -fc=ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

(例)
C で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし,4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト

#PBS -q Eduq
#PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4 

ulimit -c 0             # avoid generating core files
. /etc/profile          # enable module command
module load intel/2025
module load intelmpi/2025

cd $PBS_O_WORKDIR
mpiicc -cc=icx test.c -o test.x
mpirun -np 4 ./test.x

* ジョブの投入方法は,ジョブの実行 を参照して下さい.

Open MPI

Open MPIを使用する場合は,コンパイラのコマンドを環境変数で指定します.ここではGNUコンパイラの場合を示します. C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ export OMPI_CC=gcc
$ mpicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ export OMPI_CXX=g++
$ mpicxx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい.

$ export OMPI_FC=gfortran
$ mpif90 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

$ export OMPI_F77=gfortran
$ mpif77 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

(例)
Fortran で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし,4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト

#PBS -q Eduq
#PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4

ulimit -c 0             # avoid generating core files
. /etc/profile          # enable module command
module load intel/2025
module load openmpi5.04

cd $PBS_O_WORKDIR

mpiifort -fc=ifx test.f90 -o test.x
mpirun -np 4 ./test.x

* ジョブの投入方法は,ジョブの実行 を参照して下さい.