2と20のリビジョン間の差分 (その間の編集: 18回)

プログラムのコンパイル

Intel コンパイラ

C で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

$ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

$ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

$ ifort ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

GNU コンパイラ

C で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ gcc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ g++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ gfortran ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Intel MPI

C で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ mpiicc -cc=icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ mpiicpc -cxx=icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ mpiifort -fc=ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

(例)
C で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト

#PBS -q wEduq
#PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4
#PBS -v DOCKER_IMAGE=mpi-env:latest,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw"

ulimit -c 0          # avoid generating core files
source /etc/profile  # enable mocule command
. /common/intel-2022/compiler/latest/env/vars.sh  # Intel compiler
. /common/intel-2022/mpi/latest/env/vars.sh       # Intel MPI
. /common/intel-2022/mkl/latest/env/vars.sh       # Intel MKL

cd $PBS_O_WORKDIR

mpiicc -cc=icx test.c -o test.x
mpirun -np 4 ./test.x

* ジョブの投入方法は，ジョブの実行を参照して下さい．

Open MPI

C で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ mpicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ mpicpc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ mpif90 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

$ mpif77 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

(例)
Fortran で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト

#PBS -q wEduq
#PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4
#PBS -v DOCKER_IMAGE=mpi-env:latest,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw"

source /etc/profile
module load intel
module load openmpi.intel-4.0.1

cd $PBS_O_WORKDIR

mpiif90 test.f90 -o test.x
mpirun -np 4 ./test.x

* ジョブの投入方法は，ジョブの実行を参照して下さい．

-  ⇤ ← 2019-08-21 06:18:53時点のリビジョン2 → 
  サイズ: 2445
  編集者: hitachi28
  コメント:
+   ← 2024-05-02 05:58:54時点のリビジョン20 → ⇥
  サイズ: 4374
  編集者: yi041
  コメント:
-削除された箇所はこのように表示されます。
+追加された箇所はこのように表示されます。
 行 2:
-=== Intel コンパイラ ===
C/C++ で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+== Intel コンパイラ ==
C で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
 行 5:
+{{{
$ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
-行 8:
+行 11:
-Fortran で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 10:
+行 13:
+{{{
$ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
{{{
$ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

{{{
$ ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
-行 13:
+行 27:
-=== PGI コンパイラ ===
C/C++ で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

{{{
$ pgcc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
Fortran で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

{{{
$ pgf90 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
{{{
$ pgf77 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
=== GNU コンパイラ ===
C/C++ で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+== GNU コンパイラ ==
C で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
 行 33:
-=== Fortranコンパイラ ===
Fortran で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

{{{
$ g++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 39:
+行 43:
-=== Intel MPI ===
C/C++ で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+== Intel MPI ==
C で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 43:
+行 47:
-$ mpiicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
+$ mpiicc -cc=icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
-行 45:
+行 49:
-Fortran で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 48:
+行 52:
-$ mpiifortソースファイル名 -o 出力するプログラム名
+$ mpiicpc -cxx=icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
-行 50:
+行 54:
-=== OpenMPI ===
C/C++ で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

{{{
$ mpiifort -fc=ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
(例)<<BR>>C で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト

{{{
#!/bin/bash
#PBS -q wEduq
#PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4
#PBS -v DOCKER_IMAGE=mpi-env:latest,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw"

ulimit -c 0          # avoid generating core files
source /etc/profile  # enable mocule command
. /common/intel-2022/compiler/latest/env/vars.sh  # Intel compiler
. /common/intel-2022/mpi/latest/env/vars.sh       # Intel MPI
. /common/intel-2022/mkl/latest/env/vars.sh       # Intel MKL

cd $PBS_O_WORKDIR

mpiicc -cc=icx test.c -o test.x
mpirun -np 4 ./test.x
}}}

* ジョブの投入方法は，[[https://hpcportal.imc.tut.ac.jp/wiki/HowToSubmitJob|ジョブの実行]] を参照して下さい．

== Open MPI ==
C で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 56:
+行 87:
-Fortran で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

{{{
$ mpicpc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 64:
+行 100:
+(例)<<BR>>Fortran で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト

{{{
#!/bin/bash
#PBS -q wEduq
#PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4
#PBS -v DOCKER_IMAGE=mpi-env:latest,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw"

source /etc/profile
module load intel
module load openmpi.intel-4.0.1

cd $PBS_O_WORKDIR

mpiif90 test.f90 -o test.x
mpirun -np 4 ./test.x
}}}

* ジョブの投入方法は，[[https://hpcportal.imc.tut.ac.jp/wiki/HowToSubmitJob|ジョブの実行]] を参照して下さい．