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C で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. | 窓口サーバで利用できます.コンパイルを行う前に,moduleコマンドを実行してください. {{{ $ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} |
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C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. {{{ $ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. |
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{{{ $ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. |
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{{{ $ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} {{{ $ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. |
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. |
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{{{ $ ifort ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} |
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行 28: | 行 24: |
C で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. |
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. |
行 33: | 行 28: |
C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. | |
行 35: | 行 29: |
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. | |
行 38: | 行 33: |
Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. | |
行 40: | 行 34: |
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. | |
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== Intel MPI == C/C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. |
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行 46: | 行 39: |
== AMD コンパイラ (AOCC) == C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. {{{ $ clang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. {{{ $ clang++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. {{{ $ flang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} == Intel MPI (Intel コンパイラとの組み合わせ) == C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. |
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行 49: | 行 60: |
C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. | |
行 51: | 行 61: |
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. | |
行 54: | 行 65: |
Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. | Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. |
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(例)<<BR>>C で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし,4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト | |
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== Open MPI == Open MPIを使用する場合は,コンパイラのコマンドを環境変数で指定します.ここではGNUコンパイラの場合を示します. C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. |
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#!/bin/bash #PBS -q wEduq #PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4 #PBS -v DOCKER_IMAGE=mpi-env:latest,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw" source /etc/profile source /common/intel-2022/setvars.sh &> /dev/null cd $PBS_O_WORKDIR mpiicc -cc=icx test.c -o test.x mpirun -np 4 ./test.x |
$ export OMPI_CC=gcc $ mpicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 |
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* ジョブの投入方法は,[[https://hpcportal.imc.tut.ac.jp/wiki/HowToSubmitJob|ジョブの実行]] を参照して下さい. | C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. {{{ $ export OMPI_CXX=g++ $ mpicxx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} |
行 78: | 行 85: |
== Open MPI == C で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. |
Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. |
行 82: | 行 87: |
$ mpicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. {{{ $ mpicpc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行して下さい. {{{ |
$ export OMPI_FC=gfortran |
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$ export OMPI_F77=gfortran | |
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(例)<<BR>>Fortran で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし,4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト | |
行 99: | 行 95: |
== ROCm環境のコンパイル == 計算サーバのAMD GPUを利用するためのコンパイルコマンドです. 事前にインタラクティブジョブにより計算サーバに移動してください. |
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#!/bin/bash #PBS -q wEduq #PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4 #PBS -v DOCKER_IMAGE=mpi-env:latest,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw" source /etc/profile module load intel module load openmpi.intel-4.0.7 cd $PBS_O_WORKDIR mpiif90 test.f90 -o test.x mpirun -np 4 ./test.x |
$ qsub -I -q Eduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_amd_2025.01.sif |
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* ジョブの投入方法は,[[https://hpcportal.imc.tut.ac.jp/wiki/HowToSubmitJob|ジョブの実行]] を参照して下さい. | C言語もしくはC++で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. {{{ $ hipcc -I/opt/rocm/include -D__HIP_PLATFORM_AMD__ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} == CUDAを利用する場合のコンパイル == CUDAによりIoT・AI基盤システムのNVIDIA GPUを利用するためのコンパイルコマンドです. 事前にインタラクティブジョブによりIoT・AI基盤システムの計算サーバに移動してください. {{{ $ qsub -I -q iEduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_intel_2025.01.sif }}} C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. {{{ $ nvcc -ccbin gcc -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} C++で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. {{{ $ nvcc -ccbin g++ -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} Fortranで記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください. {{{ $ nvfortran -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} * インタラクティブジョブの詳細については,[[https://hpcportal.imc.tut.ac.jp/wiki/HowToSubmitJob|ジョブの実行]] を参照して下さい. |
プログラムのコンパイル
Intel コンパイラ
窓口サーバで利用できます.コンパイルを行う前に,moduleコマンドを実行してください.
$ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
$ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
$ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
$ ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
GNU コンパイラ
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
$ gcc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
$ g++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
$ gfortran ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
AMD コンパイラ (AOCC)
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
$ clang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
$ clang++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
$ flang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Intel MPI (Intel コンパイラとの組み合わせ)
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
$ mpiicc -cc=icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
$ mpiicpc -cxx=icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
$ mpiifort -fc=ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Open MPI
Open MPIを使用する場合は,コンパイラのコマンドを環境変数で指定します.ここではGNUコンパイラの場合を示します. C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
$ export OMPI_CC=gcc $ mpicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
$ export OMPI_CXX=g++ $ mpicxx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
$ export OMPI_FC=gfortran $ mpif90 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
$ export OMPI_F77=gfortran $ mpif77 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
ROCm環境のコンパイル
計算サーバのAMD GPUを利用するためのコンパイルコマンドです. 事前にインタラクティブジョブにより計算サーバに移動してください.
$ qsub -I -q Eduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_amd_2025.01.sif
C言語もしくはC++で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
$ hipcc -I/opt/rocm/include -D__HIP_PLATFORM_AMD__ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
CUDAを利用する場合のコンパイル
CUDAによりIoT・AI基盤システムのNVIDIA GPUを利用するためのコンパイルコマンドです. 事前にインタラクティブジョブによりIoT・AI基盤システムの計算サーバに移動してください.
$ qsub -I -q iEduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_intel_2025.01.sif
C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
$ nvcc -ccbin gcc -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++で記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
$ nvcc -ccbin g++ -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortranで記述されたプログラムをコンパイルするには,以下のコマンドを実行してください.
$ nvfortran -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
* インタラクティブジョブの詳細については,ジョブの実行 を参照して下さい.