15と22のリビジョン間の差分 (その間の編集: 7回)

プログラムのコンパイル

Intel コンパイラ

C で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

$ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

$ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

$ ifort ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

GNU コンパイラ

C で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ gcc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ g++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ gfortran ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Intel MPI

C で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ mpiicc -cc=icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ mpiicpc -cxx=icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ mpiifort -fc=ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

(例)
C で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト

#PBS -q wEduq
#PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4
#PBS -v DOCKER_IMAGE=mpi-env:latest

ulimit -c 0          # avoid generating core files
source /etc/profile  # enable module command
. /common/intel-2022/compiler/latest/env/vars.sh  # Intel compiler
. /common/intel-2022/mkl/latest/env/vars.sh       # Intel MKL
. /common/intel-2022/mpi/latest/env/vars.sh       # Intel MPI

cd $PBS_O_WORKDIR

mpiicc -cc=icx test.c -o test.x
mpirun -np 4 ./test.x

* ジョブの投入方法は，ジョブの実行を参照して下さい．

Open MPI

C で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ mpicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ mpicpc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．

$ mpif90 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

$ mpif77 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

(例)
Fortran で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト

#PBS -q wEduq
#PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4
#PBS -v DOCKER_IMAGE=mpi-env:latest,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw"

ulimit -c 0          # avoid generating core files
source /etc/profile  # enable module command
module load openmpi.intel-4.0.1

cd $PBS_O_WORKDIR

mpiifort -fc=ifx test.f90 -o test.x
mpirun -np 4 ./test.x

* ジョブの投入方法は，ジョブの実行を参照して下さい．

-  ⇤ ← 2024-01-23 02:03:41時点のリビジョン15 → 
  サイズ: 4471
  編集者: yi041
  コメント:
+   ← 2024-06-01 12:27:18時点のリビジョン22 → ⇥
  サイズ: 4404
  編集者: yi041
  コメント:
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+追加された箇所はこのように表示されます。
 行 3:
-C で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+C で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
 行 11:
-C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
+C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
 行 19:
-Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
 行 28:
-C で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+C で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
 行 33:
-C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
 行 38:
-Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
 行 44:
-C/C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+C で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
 行 49:
-C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
 行 54:
-Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
 行 59:
-(例)<<BR>>Fortran で記述された計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルする場合の実行スクリプト
+(例)<<BR>>C で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト
 行 62:
-#!/bin/bash #PBS -q gSrchq  #PBS -o out.intelmpi 
#PBS -j oe 
#PBS -l select=2:ncpus=2 
#PBS -l walltime=1:00:00 
#PBS -v DOCKER_IMAGE=prg-env:2019.10.02,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw" 
#PBS -N impitest
+#!/bin/bash
#PBS -q wEduq
#PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4
#PBS -v DOCKER_IMAGE=mpi-env:latest
-行 70:
+行 67:
-source /etc/profile 
module load intel 
module load intelmpi.intel
+ulimit -c 0          # avoid generating core files
source /etc/profile  # enable module command
. /common/intel-2022/compiler/latest/env/vars.sh  # Intel compiler
. /common/intel-2022/mkl/latest/env/vars.sh       # Intel MKL
. /common/intel-2022/mpi/latest/env/vars.sh       # Intel MPI
-行 74:
+行 73:
-cd ${PBS_O_WORKDIR}
+cd $PBS_O_WORKDIR
-行 76:
+行 75:
-prog=mpi-ping-intelmpi.x 
mpiicc mpi-ping.c -o $prog 
mpirun -np 2 -ppn 1 -hostfile ${PBS_NODEFILE} hostname 
mpirun -np 2 -ppn 1 -hostfile ${PBS_NODEFILE} ./$prog -B -r 1 1m 
}}}
+mpiicc -cc=icx test.c -o test.x
mpirun -np 4 ./test.x
}}}
-行 85:
+行 82:
-C で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+C で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 90:
+行 87:
-C++ で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 95:
+行 92:
-Fortran で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 103:
+行 100:
-(例)<<BR>>Fortran で記述された計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルする場合の実行スクリプト
+(例)<<BR>>Fortran で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト
-行 106:
+行 103:
-#!/bin/bash 
#PBS -q gSrchq  #PBS -o out.openmpi 
#PBS -j oe 
#PBS -l select=2:ncpus=2 
#PBS -l walltime=1:00:00 
#PBS -v DOCKER_IMAGE=prg-env:2019.10.02,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw"  #PBS -N impitest
+#!/bin/bash
#PBS -q wEduq
#PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4
#PBS -v DOCKER_IMAGE=mpi-env:latest,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw"
-行 115:
+行 108:
-source /etc/profile 
module load intel
+ulimit -c 0          # avoid generating core files
source /etc/profile  # enable module command
-行 119:
+行 112:
-cd ${PBS_O_WORKDIR}
+cd $PBS_O_WORKDIR
-行 121:
+行 114:
-prog=mpi-ping-openmpi.x 
mpicc mpi-ping.c -o $prog 
mpirun -np 2 -N 1 -hostfile ${PBS_NODEFILE} hostname 
mpirun -np 2 -N 1 -hostfile ${PBS_NODEFILE} ./$prog -B -r 1 1m 
}}}
+mpiifort -fc=ifx test.f90 -o test.x
mpirun -np 4 ./test.x
}}}