14と27のリビジョン間の差分 (その間の編集: 13回)

プログラムのコンパイル

Intel コンパイラ

窓口サーバで利用できます．コンパイルを行う前に，moduleコマンドを実行してください．

$ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

GNU コンパイラ

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ gcc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ g++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ gfortran ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

AMD コンパイラ (AOCC)

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ clang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ clang++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ flang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Intel MPI (Intel コンパイラとの組み合わせ)

C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ mpiicc -cc=icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ mpiicpc -cxx=icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ mpiifort -fc=ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Open MPI

Open MPIを使用する場合は，コンパイラのコマンドを環境変数で指定します．ここではGNUコンパイラの場合を示します． C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ export OMPI_CC=gcc
$ mpicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ export OMPI_CXX=g++
$ mpicxx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ export OMPI_FC=gfortran
$ mpif90 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

$ export OMPI_F77=gfortran
$ mpif77 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

ROCm環境のコンパイル

計算サーバのAMD GPUを利用するためのコンパイルコマンドです．事前にインタラクティブジョブにより計算サーバに移動してください．

$ qsub -I -q Eduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_amd_2025.01.sif

C言語もしくはC++で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ hipcc -I/opt/rocm/include -D__HIP_PLATFORM_AMD__ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

CUDAを利用する場合のコンパイル

CUDAによりIoT・AI基盤システムのNVIDIA GPUを利用するためのコンパイルコマンドです．事前にインタラクティブジョブによりIoT・AI基盤システムの計算サーバに移動してください．

$ qsub -I -q iEduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_intel_2025.01.sif

C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ nvcc -ccbin gcc -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

C++で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ nvcc -ccbin g++ -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

Fortranで記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．

$ nvfortran -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名

* インタラクティブジョブの詳細については，ジョブの実行を参照して下さい．

-  ⇤ ← 2024-01-23 01:57:21時点のリビジョン14 → 
  サイズ: 4238
  編集者: yi041
  コメント:
+   ← 2025-06-09 03:12:09時点のリビジョン27 → ⇥
  サイズ: 5777
  編集者: yi041
  コメント:
-削除された箇所はこのように表示されます。
+追加された箇所はこのように表示されます。
 行 3:
-C で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+窓口サーバで利用できます．コンパイルを行う前に，moduleコマンドを実行してください．
{{{
$ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
-行 5:
+行 8:
+C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 8:
+行 17:
-{{{
$ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 13:
+行 18:
-{{{
$ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
{{{
$ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 24:
+行 22:
-{{{
$ ifort ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
-行 28:
+行 24:
-C で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 33:
+行 28:
-C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 35:
+行 29:
+C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 37:
+行 32:
+}}}
-行 38:
+行 34:
-}}}
Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 44:
+行 38:
-== Intel MPI ==
C/C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 47:
+行 39:
+== AMD コンパイラ (AOCC) ==
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ clang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ clang++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ flang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

== Intel MPI (Intel コンパイラとの組み合わせ) ==
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 50:
+行 60:
-C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 52:
+行 61:
+C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 54:
+行 64:
-行 56:
+行 65:
-Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 61:
+行 70:
-(例)<<BR>>Fortran で記述された計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルする場合の実行スクリプト

{{{#!/bin/bash
#PBS -q gSrchq
#PBS -o out.intelmpi
#PBS -j oe
#PBS -l select=2:ncpus=2
#PBS -l walltime=1:00:00
#PBS -v DOCKER_IMAGE=prg-env:2019.10.02,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw"
#PBS -N impitest

source /etc/profile
module load intel
module load intelmpi.intel

cd ${PBS_O_WORKDIR}

prog=mpi-ping-intelmpi.x
mpiicc mpi-ping.c -o $prog
mpirun -np 2 -ppn 1 -hostfile ${PBS_NODEFILE} hostname
mpirun -np 2 -ppn 1 -hostfile ${PBS_NODEFILE} ./$prog -B -r 1 1m
}}}
* ジョブの投入方法は，[[https://hpcportal.imc.tut.ac.jp/wiki/HowToSubmitJob|ジョブの実行]] を参照して下さい．
-行 86:
+行 72:
-C/C++ で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
+Open MPIを使用する場合は，コンパイラのコマンドを環境変数で指定します．ここではGNUコンパイラの場合を示します．
C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 89:
+行 75:
+$ export OMPI_CC=gcc
-行 91:
+行 78:
-Fortran で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
-行 93:
+行 79:
+C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
-行 94:
+行 81:
+$ export OMPI_CXX=g++
$ mpicxx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ export OMPI_FC=gfortran
-行 97:
+行 91:
+$ export OMPI_F77=gfortran
-行 99:
+行 94:
-(例)<<BR>>Fortran で記述された計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルする場合の実行スクリプト
-行 101:
+行 95:
-{{{#!/bin/bash
#PBS -q gSrchq
#PBS -o out.openmpi
#PBS -j oe
#PBS -l select=2:ncpus=2
#PBS -l walltime=1:00:00
#PBS -v DOCKER_IMAGE=prg-env:2019.10.02,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw"
#PBS -N impitest
+== ROCm環境のコンパイル ==
計算サーバのAMD GPUを利用するためのコンパイルコマンドです．
事前にインタラクティブジョブにより計算サーバに移動してください．
{{{
$ qsub -I -q Eduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_amd_2025.01.sif
}}}
-行 110:
+行 102:
-source /etc/profile
module load intel
module load openmpi.intel-4.0.1
+C言語もしくはC++で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ hipcc -I/opt/rocm/include -D__HIP_PLATFORM_AMD__ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}
-行 114:
+行 107:
-cd ${PBS_O_WORKDIR}
+== CUDAを利用する場合のコンパイル ==
CUDAによりIoT・AI基盤システムのNVIDIA GPUを利用するためのコンパイルコマンドです．
事前にインタラクティブジョブによりIoT・AI基盤システムの計算サーバに移動してください．
{{{
$ qsub -I -q iEduq -l select=1:ncpus=1:ngpus=1 -v SINGULARITY_IMAGE=/common/Singularity_sif/prg_env_intel_2025.01.sif
}}}
-行 116:
+行 114:
-prog=mpi-ping-openmpi.x
mpicc mpi-ping.c -o $prog
mpirun -np 2 -N 1 -hostfile ${PBS_NODEFILE} hostname
mpirun -np 2 -N 1 -hostfile ${PBS_NODEFILE} ./$prog -B -r 1 1m
+C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ nvcc -ccbin gcc -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
-行 121:
+行 118:
-* ジョブの投入方法は，[[https://hpcportal.imc.tut.ac.jp/wiki/HowToSubmitJob|ジョブの実行]] を参照して下さい．
+C++で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ nvcc -ccbin g++ -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

Fortranで記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
{{{
$ nvfortran -I/usr/include ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
}}}

* インタラクティブジョブの詳細については，[[https://hpcportal.imc.tut.ac.jp/wiki/HowToSubmitJob|ジョブの実行]] を参照して下さい．