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| C で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． | C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． {{{ $ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} |
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| {{{ }}} |
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． |
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Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． |
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| $ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 | $ ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 |
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| C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください． | == GNU コンパイラ == C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． {{{ $ gcc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． {{{ $ g++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． {{{ $ gfortran ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} == AMD コンパイラ (AOCC) == C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． {{{ $ clang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． {{{ $ clang++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． {{{ $ flang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} == Intel MPI (Intel コンパイラとの組み合わせ) == C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． {{{ $ mpiicc -cc=icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． {{{ $ mpiicpc -cxx=icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． |
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| $ mpiifort -fc=ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 | |
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| (例)<<BR>>C で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト |
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| $ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 | #!/bin/bash #PBS -q Eduq #PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4 ulimit -c 0 # avoid generating core files . /etc/profile # enable module command module load intel/2025 module load intelmpi/2025 cd $PBS_O_WORKDIR mpiicc -cc=icx test.c -o test.x mpirun -np 4 ./test.x |
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* ジョブの投入方法は，[[https://hpcportal.imc.tut.ac.jp/wiki/HowToSubmitJob|ジョブの実行]] を参照して下さい． == Open MPI == Open MPIを使用する場合は，コンパイラのコマンドを環境変数で指定します．ここではGNUコンパイラの場合を示します． C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． |
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| $ icc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 | $ export OMPI_CC=gcc $ mpicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． {{{ $ export OMPI_CXX=g++ $ mpicxx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 |
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| }}} {{{ }}} {{{ }}} {{{ }}} {{{ }}} {{{ }}} {{{ }}} {{{ $ ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 $ ifort ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} == GNU コンパイラ == C で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． {{{ $ gcc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． {{{ $ g++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． {{{ $ gfortran ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} == Intel MPI == C/C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． {{{ $ mpiicc -cc=icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． {{{ $ mpiicpc -cxx=icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． {{{ $ mpiifort -fc=ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} (例)<<BR>>Fortran で記述された計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルする場合の実行スクリプト {{{#!/bin/bash #PBS -q gSrchq #PBS -o out.intelmpi #PBS -j oe #PBS -l select=2:ncpus=2 #PBS -l walltime=1:00:00 #PBS -v DOCKER_IMAGE=prg-env:2019.10.02,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw" #PBS -N impitest source /etc/profile module load intel module load intelmpi.intel cd ${PBS_O_WORKDIR} prog=mpi-ping-intelmpi.x mpiicc mpi-ping.c -o $prog mpirun -np 2 -ppn 1 -hostfile ${PBS_NODEFILE} hostname mpirun -np 2 -ppn 1 -hostfile ${PBS_NODEFILE} ./$prog -B -r 1 1m }}} * ジョブの投入方法は，[[https://hpcportal.imc.tut.ac.jp/wiki/HowToSubmitJob|ジョブの実行]] を参照して下さい． == Open MPI == C/C++ で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． {{{ $ mpicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名 }}} Fortran で記述された計算プログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい． {{{ |
$ export OMPI_FC=gfortran |
| 行 114: | 行 104: |
| $ export OMPI_F77=gfortran | |
| 行 116: | 行 107: |
| (例)<<BR>>Fortran で記述された計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルする場合の実行スクリプト | |
| 行 118: | 行 108: |
| {{{#!/bin/bash #PBS -q gSrchq #PBS -o out.openmpi #PBS -j oe #PBS -l select=2:ncpus=2 #PBS -l walltime=1:00:00 #PBS -v DOCKER_IMAGE=prg-env:2019.10.02,DOCKER_OPTIONS="--network=overlaynw" #PBS -N impitest |
(例)<<BR>>Fortran で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト |
| 行 127: | 行 110: |
| source /etc/profile module load intel module load openmpi.intel-4.0.1 |
{{{ #!/bin/bash #PBS -q Eduq #PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4 |
| 行 131: | 行 115: |
| cd ${PBS_O_WORKDIR} | ulimit -c 0 # avoid generating core files . /etc/profile # enable module command module load intel/2025 module load openmpi5.04 |
| 行 133: | 行 120: |
| prog=mpi-ping-openmpi.x mpicc mpi-ping.c -o $prog mpirun -np 2 -N 1 -hostfile ${PBS_NODEFILE} hostname mpirun -np 2 -N 1 -hostfile ${PBS_NODEFILE} ./$prog -B -r 1 1m |
cd $PBS_O_WORKDIR mpiifort -fc=ifx test.f90 -o test.x mpirun -np 4 ./test.x |
| 行 138: | 行 125: |
プログラムのコンパイル
Intel コンパイラ
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
$ icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行してください．
$ icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
$ ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
GNU コンパイラ
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
$ gcc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
$ g++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
$ gfortran ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
AMD コンパイラ (AOCC)
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
$ clang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
$ clang++ ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
$ flang ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Intel MPI (Intel コンパイラとの組み合わせ)
C言語で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
$ mpiicc -cc=icx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++ で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
$ mpiicpc -cxx=icpx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortran で記述されたソースコードをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
$ mpiifort -fc=ifx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
(例)
C で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト
#PBS -q Eduq #PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4 ulimit -c 0 # avoid generating core files . /etc/profile # enable module command module load intel/2025 module load intelmpi/2025 cd $PBS_O_WORKDIR mpiicc -cc=icx test.c -o test.x mpirun -np 4 ./test.x
* ジョブの投入方法は，ジョブの実行 を参照して下さい．
Open MPI
Open MPIを使用する場合は，コンパイラのコマンドを環境変数で指定します．ここではGNUコンパイラの場合を示します． C言語で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
$ export OMPI_CC=gcc $ mpicc ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
C++ で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
$ export OMPI_CXX=g++ $ mpicxx ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
Fortran で記述されたプログラムをコンパイルするには，以下のコマンドを実行して下さい．
$ export OMPI_FC=gfortran $ mpif90 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
$ export OMPI_F77=gfortran $ mpif77 ソースファイル名 -o 出力するプログラム名
(例)
Fortran で記述されたMPI並列計算プログラムをバッチジョブとしてコンパイルし，4プロセス並列で実行する場合のジョブスクリプト
#PBS -q Eduq #PBS -l select=1:ncpus=4:mpiprocs=4 ulimit -c 0 # avoid generating core files . /etc/profile # enable module command module load intel/2025 module load openmpi5.04 cd $PBS_O_WORKDIR mpiifort -fc=ifx test.f90 -o test.x mpirun -np 4 ./test.x
* ジョブの投入方法は，ジョブの実行 を参照して下さい．