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= クラスタシステム構成 = = システム構成 =
<<TableOfContents(3)>>
行 4: 行 5:
||<10%>分類 ||<10%>ホスト名 ||<10%>CPU ||<10%>主記憶容量 ||<10%>1ノードあたりの理論演算性能 ||<10%>GPU ||<10%>OS ||
||窓口サーバ ||ydev ||8 vコア ||24GB || || ||RHEL 9.5 ||
||PBS管理サーバ ||ypbs0～1 ||Xeon Silver 4309Y (2.8 GHz) 8 コア || || || ||RHEL 9.5 ||
||計算サーバ ||ysnd00～14 ||AMD EPYC 9254 (2.90 GHz) 24コア x2 ||256GB ||95.1TFLOPS ||AMD MI210 PCIe(64GB)x2 ||RHEL 9.5 ||
||IoT・AI基盤システム ||yind00～01 ||Intel Xeon Gold 6342 (2.8 GHz) 24コア x2 ||256GB ||24.6TFLOPS ||NVIDIA Ampere A100(80GB)x1 ||RHEL 9.5 ||

 * ydevはydev00～09のDNS共通サービス名であり，ラウンドロビンにてydev00～09に割当られます．
行 6: 行 14:
||<20%>ホーム領域 ||<20%>/home/数字/ユーザ名/ ||<40%>教育用端末と同じホーム領域が利用できます．教育用端末からは Z:\ として表示されます． ||
||<20%>ワーク領域 ||<20%>/work/ユーザ名/ ||<40%>教育用端末からは V:\ として表示されます． ||
||<20%>ソフトウェア領域 ||<20%>/common/ ||<40%> ||
行 8: 行 19:
||名称 ||サーバ ||割当ノード数 ||CPUコア数(最大/標準) ||メモリ占有量(最大/標準) ||GPU占有数(最大/標準) ||経過時間(最長) ||備考 ||
||Eduq ||計算サーバ ||15 ||8/1 ||64GiB/4GiB ||2/0 ||8H ||全ユーザが利用可能 ||
||sRchq ||計算サーバ ||13 ||48/1 ||256GiB/8GiB ||2/0 ||96H ||研究利用ユーザのみ利用可能，優先して実行 ||
||mRchq ||計算サーバ ||13 ||384/1 ||2048GiB/8GiB ||16/0 ||336H ||研究利用ユーザのみ利用可能 ||
||iEduq ||IoT・AI基盤システム ||2 ||8/1 ||64GiB/4GiB ||2/0 ||8H ||全ユーザが利用可能 ||
||iRchq ||IoT・AI基盤システム ||2 ||96/1 ||512GiB/8GiB ||0/0 ||336H ||研究利用ユーザのみ利用可能 ||

 * CPUコア数，メモリ量，GPU数はいずれも1ジョブあたりの値です．
 * これらの設定は qstat -Qf [キュー名称] で確認できます．
 * Eduq，iEduqは1ユーザにつきそれぞれ1つのジョブのみ実行できます．
 * {s,m}Rchqはysnd02～14に割り当てられます．
 * 研究利用ユーザになるためには計算機利用申込書の提出が必要です．詳しくは http://imc.tut.ac.jp/research/form を参照してください．
行 10: 行 33:

||<20%>コンパイラ||<20%>バージョン||<40%>インストールディレクトリ||
||Intel||19.0||/opt||
||PGI||19.5||/opt||
||GNU||4.8.5|| ||
||Fortran||4.8.5|| ||		 ||コンパイラ　　 ||バージョン　　 ||インストールディレクトリ　　　　　　　　　　 ||
||GNU (GCC) ||11.5 ||/usr/bin/gcc ||
||GNU (GCC) ||13.3.1 ||/opt/rh/gcc-toolset-13/root/bin/gcc ||
||Intel ||2025 ||/common/IntelOneAPI2025 ||
||AMD (AOCC) ||5.0 ||/common/AOCC5.0 ||
行 18: 行 40:

||<20%>ライブラリ||<20%>バージョン||<40%>インストールディレクトリ||
||Intel MPI||19.0||　||
||Open MPI||19.5||　||		 ||ライブラリ　　 ||バージョン　　 ||インストールディレクトリ　　　　　　　　　　 ||
||Intel MPI ||2025 ||/common/modulefiles/intelmpi/2025 ||
||OpenMPI ||5.0.7 ||/common/OpenMPI ||
||OpenMPI ||4.1.1 ||/usr/local/modulefiles ||
行 24: 行 46:
||ライブラリ　　　　　　　　　　 ||バージョン　　 ||リンク可能なコンパイラ　　 ||
||Intel Math Kernel Library (MKL) ||2025.0 ||Intelコンパイラ ||
||AMD Optimizing CPU Libraries (AOCL) ||5.0 ||AOCC ||
行 25: 行 50:
||<30%>ライブラリ||<20%>バージョン||<40%>インストールディレクトリ||
||Intel Math<<BR>>Kernel Library||2019||　||		 == Singularityコンテナ ==
||<35%>科学計算用コンテナ名称　　 ||<40%>ソフトウェア名称 ||<25%>バージョン ||
||<style="&quot; &amp; quot; &amp; amp; quot; &amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot;text-align:center&amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; quot; &amp; amp; quot; &amp; quot; &quot;" |4>prg_env_intel_2025.01 ||CUDA ||12.8 ||
||Python ||3.13.2 ||
||Perl ||5.40.2 ||
||Ruby ||3.4.1 ||
||<style="&quot; &amp; quot; &amp; amp; quot; &amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot;text-align:center&amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; amp; quot; &amp; amp; amp; quot; &amp; amp; quot; &amp; quot; &quot;" |4>prg_env_amd_2025.01 ||Radeon Open Compute (ROCm) ||6.3.3 ||
||Python ||3.13.2 ||
||Perl ||5.40.2 ||
||Ruby ||3.4.1 ||
行 28: 行 61:
== Dockerコンテナ ==  * 深層学習用のコンテナについては [[HowToRunNGCContainer|深層学習コンテナを利用する方法]] を参照ください．
 * コンテナは適宜バージョンアップアップされます．showimagesコマンドで表示される利用可能コンテナの一覧から最新のバージョンをご利用ください．
行 30: 行 64:
||コンテナ名称||ソフトウェア名称||<25%>バージョン||
||<|9>PrgEnv:2019.08||Intel Parallel Studio XE||2019||
||Intel MPI Library||2019||
||Intel Math Kernel Library||2019||
||PGI Compiler||17.7||
||OpenMPI||17.7||
||OpenBLAS||17.7||
||Python||3.7.3||
||Perl||5.30||
||Ruby||2.6.3||
 
行 42: 行 65:
=== 窓口サーバ用アプリケーション ===
||<30%>名称 ||<20%>バージョン ||<50%>説明 ||
||Emacs ||27.2 ||エディタ ||
||Visual Studio Code ||1.97.2 ||エディタ ||
||Perl ||5.32 ||プログラミング言語 ||
||Python ||3.12.5 ||プログラミング言語 ||
||Ruby ||3.0.7p220 ||プログラミング言語 ||
||Eigen ||3.4.0 ||行列ベクトル演算ライブラリ ||
||OpenJDK ||1.8.0_442 ||Java開発環境 ||
||MATLAB ||R2024b ||数値計算ソフトウェア ||
||Google Chrome ||133 ||Webブラウザ ||
||Mozilla Firefox ||18.7.0 ||Webブラウザ ||
||Evince ||40.5 ||PDFビューワ ||
||Libre Office ||5.3.6.1 ||Officeソフトウェア ||
||TeX Live 2020 ||3.14159265 ||組版処理ソフトウェア ||
||gnuplot ||5.4 ||グラフ作成 ||
||tgif ||4.2 ||作図ツール ||
||inkspace ||1.1 ||作図ツール ||
||dia ||0.97.3 ||ダイアグラム作成 ||
||Gimp ||2.99.8 ||画像編集 ||
||Image Magick ||6.9.3.17-1 ||画像表示/変換 ||
||GTK+ ||4 ||GUIライブラリ ||
||Ghostscript ||9.54 ||日本語対応Post Script処理系 ||
行 43: 行 89:
||<10%>ソフトウェア名称||<10%>バージョン||<35%>説明||<20%>インストールディレクトリ||
||||||||構造解析||
||ANSYS Multiphysics||19.||マルチフィジックス解析ツール||/common/||
||ANSYS CFX||19.||汎用熱流体解析ソフトウェア||/common/||
||ABAQUS|| ||汎用非線形有限要素解析プログラム||/common/||
||COMSOL Multiphysics|| ||有限要素法を用いた汎用物理シミュレーションソフト||/common/||
||Patran|| ||CAE環境統合プリ・ポストソフトウェア||/common/||
||||||||電磁界解析||
||ANSYS HFSS||19.||高周波3次元電磁界解析ソフトウェア||/common/||
||||||||計算化学||
||Gaussian/GaussView|| ||量子化学計算ソフトウェア||/common/||
||||||||技術処理||
||MATLAB||R2018b||数値計算ソフトウェア||　||
行 57: 行 90:
 * ANSYS, ABAQUS, Patran, COMSOL, GAUSSIAN, MATLABの利用には登録種別Aへの利用登録が必要です．
 * 登録種別Aの申請方法は http://imc.tut.ac.jp/research/form を参照してください．		 === 研究用アプリケーション ===
||アプリケーション||バージョン||説明||インストールディレクトリ||
||ABAQUS||2025||汎用非線形有限要素解析プログラム||/common/ABAQUS/2025||
||ANSYS HFSS||2024r1||高周波3次元電磁界解析ソフトウェア||/common/HFSS||
||COMSOL Multiphysics||6.3||有限要素法を用いた汎用物理シミュレーションソフトウェア||/common/COMSOLMultiphysics||
||Gaussian||16 Rev.C.01||量子化学計算ソフトウェア||/common/Gaussian||
||Materials Studio||2025||分子モデリング・シミュレーション||/common/MaterialsStudio/MaterialsStudio25.1||

 * HPCクラスタにて研究目的で研究用アプリケーションを利用するには，計算機利用申込書の提出が必要です．
 * 申請方法は http://imc.tut.ac.jp/research/form を参照してください．

システム構成

目次

  1. システム構成
    1. ハードウェア構成
    2. ファイルシステム構成
    3. キュー構成
    4. コンパイラ
    5. メッセージ通信ライブラリ（MPI）
    6. 数値計算ライブラリ
    7. Singularityコンテナ
    8. アプリケーション
      1. 窓口サーバ用アプリケーション
      2. 研究用アプリケーション

ハードウェア構成

分類

ホスト名

CPU

主記憶容量

1ノードあたりの理論演算性能

GPU

OS

窓口サーバ

ydev

8 vコア

24GB

RHEL 9.5

PBS管理サーバ

ypbs0～1

Xeon Silver 4309Y (2.8 GHz) 8 コア

RHEL 9.5

計算サーバ

ysnd00～14

AMD EPYC 9254 (2.90 GHz) 24コア x2

256GB

95.1TFLOPS

AMD MI210 PCIe(64GB)x2

RHEL 9.5

IoT・AI基盤システム

yind00～01

Intel Xeon Gold 6342 (2.8 GHz) 24コア x2

256GB

24.6TFLOPS

NVIDIA Ampere A100(80GB)x1

RHEL 9.5

  • ydevはydev00～09のDNS共通サービス名であり，ラウンドロビンにてydev00～09に割当られます．

ファイルシステム構成

ホーム領域

/home/数字/ユーザ名/

教育用端末と同じホーム領域が利用できます．教育用端末からは Z:\ として表示されます．

ワーク領域

/work/ユーザ名/

教育用端末からは V:\ として表示されます．

ソフトウェア領域

/common/

キュー構成

名称

サーバ

割当ノード数

CPUコア数(最大/標準)

メモリ占有量(最大/標準)

GPU占有数(最大/標準)

経過時間(最長)

備考

Eduq

計算サーバ

15

8/1

64GiB/4GiB

2/0

8H

全ユーザが利用可能

sRchq

計算サーバ

13

48/1

256GiB/8GiB

2/0

96H

研究利用ユーザのみ利用可能，優先して実行

mRchq

計算サーバ

13

384/1

2048GiB/8GiB

16/0

336H

研究利用ユーザのみ利用可能

iEduq

IoT・AI基盤システム

2

8/1

64GiB/4GiB

2/0

8H

全ユーザが利用可能

iRchq

IoT・AI基盤システム

2

96/1

512GiB/8GiB

0/0

336H

研究利用ユーザのみ利用可能

  • CPUコア数，メモリ量，GPU数はいずれも1ジョブあたりの値です．
  • これらの設定は qstat -Qf [キュー名称] で確認できます．
  • Eduq，iEduqは1ユーザにつきそれぞれ1つのジョブのみ実行できます．
  • {s,m}Rchqはysnd02～14に割り当てられます．

  • 研究利用ユーザになるためには計算機利用申込書の提出が必要です．詳しくは http://imc.tut.ac.jp/research/form を参照してください．

コンパイラ

コンパイラ　　

バージョン　　

インストールディレクトリ　　　　　　　　　　

GNU (GCC)

11.5

/usr/bin/gcc

GNU (GCC)

13.3.1

/opt/rh/gcc-toolset-13/root/bin/gcc

Intel

2025

/common/IntelOneAPI2025

AMD (AOCC)

5.0

/common/AOCC5.0

メッセージ通信ライブラリ（MPI）

ライブラリ　　

バージョン　　

インストールディレクトリ　　　　　　　　　　

Intel MPI

2025

/common/modulefiles/intelmpi/2025

OpenMPI

5.0.7

/common/OpenMPI

OpenMPI

4.1.1

/usr/local/modulefiles

数値計算ライブラリ

ライブラリ　　　　　　　　　　

バージョン　　

リンク可能なコンパイラ　　

Intel Math Kernel Library (MKL)

2025.0

Intelコンパイラ

AMD Optimizing CPU Libraries (AOCL)

5.0

AOCC

Singularityコンテナ

科学計算用コンテナ名称　　

ソフトウェア名称

バージョン

prg_env_intel_2025.01

CUDA

12.8

Python

3.13.2

Perl

5.40.2

Ruby

3.4.1

prg_env_amd_2025.01

Radeon Open Compute (ROCm)

6.3.3

Python

3.13.2

Perl

5.40.2

Ruby

3.4.1

  • 深層学習用のコンテナについては 深層学習コンテナを利用する方法 を参照ください．

  • コンテナは適宜バージョンアップアップされます．showimagesコマンドで表示される利用可能コンテナの一覧から最新のバージョンをご利用ください．

アプリケーション

窓口サーバ用アプリケーション

名称

バージョン

説明

Emacs

27.2

エディタ

Visual Studio Code

1.97.2

エディタ

Perl

5.32

プログラミング言語

Python

3.12.5

プログラミング言語

Ruby

3.0.7p220

プログラミング言語

Eigen

3.4.0

行列ベクトル演算ライブラリ

OpenJDK

1.8.0_442

Java開発環境

MATLAB

R2024b

数値計算ソフトウェア

Google Chrome

133

Webブラウザ

Mozilla Firefox

18.7.0

Webブラウザ

Evince

40.5

PDFビューワ

Libre Office

5.3.6.1

Officeソフトウェア

TeX Live 2020

3.14159265

組版処理ソフトウェア

gnuplot

5.4

グラフ作成

tgif

4.2

作図ツール

inkspace

1.1

作図ツール

dia

0.97.3

ダイアグラム作成

Gimp

2.99.8

画像編集

Image Magick

6.9.3.17-1

画像表示/変換

GTK+

4

GUIライブラリ

Ghostscript

9.54

日本語対応Post Script処理系

研究用アプリケーション

アプリケーション

バージョン

説明

インストールディレクトリ

ABAQUS

2025

汎用非線形有限要素解析プログラム

/common/ABAQUS/2025

ANSYS HFSS

2024r1

高周波3次元電磁界解析ソフトウェア

/common/HFSS

COMSOL Multiphysics

6.3

有限要素法を用いた汎用物理シミュレーションソフトウェア

/common/COMSOLMultiphysics

Gaussian

16 Rev.C.01

量子化学計算ソフトウェア

/common/Gaussian

Materials Studio

2025

分子モデリング・シミュレーション

/common/MaterialsStudio/MaterialsStudio25.1
  • HPCクラスタにて研究目的で研究用アプリケーションを利用するには，計算機利用申込書の提出が必要です．

  • 申請方法は http://imc.tut.ac.jp/research/form を参照してください．

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