クラスタシステム構成
目次
ハードウェア構成
分類 |
ホスト名 |
CPU |
主記憶容量 |
1ノードあたりの理論演算性能 |
GPU |
OS |
窓口サーバ |
ydev |
8 vコア |
24GB |
|
|
RHEL 9.5 |
PBS管理サーバ |
ypbs0～1 |
Xeon Silver 4309Y (2.8 GHz) 8 コア |
|
|
|
RHEL 9.5 |
計算サーバ |
ysnd00～14 |
AMD EPYC 9254 (2.90 GHz) 24コア x2 |
256GB |
95.1TFLOPS |
AMD MI210 PCIe(64GB)x2 |
RHEL 9.5 |
IoT・AI基盤システム |
yind00～01 |
Intel Xeon Gold 6342 (2.8 GHz) 24コア x2 |
256GB |
24.6TFLOPS |
NVIDIA Ampere A100(80GB)x1 |
RHEL 9.5 |
- ydevはydev00～09のDNS共通サービス名であり，ラウンドロビンにてydev00～09に割当られます．
ファイルシステム構成
ホーム領域 |
/home/数字/ユーザ名/ |
教育用端末と同じホーム領域が利用できます．教育用端末からは Z:\ として表示されます． |
ワーク領域 |
/work/ユーザ名/ |
教育用端末からは V:\ として表示されます． |
ソフトウェア領域 |
/common/ |
|
キュー構成
名称 |
サーバ |
割当ノード数 |
CPUコア数(最大/標準) |
メモリ占有量(最大/標準) |
GPU占有数(最大/標準) |
経過時間(最長) |
備考 |
Eduq |
計算サーバ |
15 |
8/1 |
64GiB/4GiB |
2/0 |
8H |
全ユーザが利用可能 |
sRchq |
計算サーバ |
13 |
48/1 |
256GiB/8GiB |
2/0 |
96H |
研究利用ユーザのみ利用可能，優先して実行 |
mRchq |
計算サーバ |
13 |
384/1 |
2048GiB/8GiB |
16/0 |
336H |
研究利用ユーザのみ利用可能 |
iEduq |
IoT・AI基盤システム |
2 |
8/1 |
64GiB/4GiB |
1/0 |
8H |
全ユーザが利用可能 |
iRchq |
IoT・AI基盤システム |
2 |
96/1 |
512GiB/8GiB |
0/0 |
336H |
研究利用ユーザのみ利用可能 |
- CPUコア数，メモリ量，GPU数はいずれも1ジョブあたりの値です．
- これらの設定は qstat -Qf [キュー名称] で確認できます．
- Eduq，iEduqは1ユーザにつきそれぞれ1つのジョブのみ実行できます．
- sRchqは1ユーザにつき最大20個のジョブを同時実行できます．
- {s,m}Rchqはysnd02～14に割り当てられます．
研究利用ユーザになるためには計算機利用申込書の提出が必要です．詳しくは こちら を参照してください．
コンパイラ
コンパイラ |
バージョン |
インストールディレクトリ |
GNU (GCC) |
11.5 |
/usr/bin/gcc |
GNU (GCC) |
13.3.1 |
/opt/rh/gcc-toolset-13/root/bin/gcc |
Intel |
2025 |
/common/IntelOneAPI2025 |
AMD (AOCC) |
5.0 |
/common/AOCC5.0 |
メッセージ通信ライブラリ（MPI）
ライブラリ |
バージョン |
インストールディレクトリ |
Intel MPI |
2025 |
/common/modulefiles/intelmpi/2025 |
OpenMPI |
5.0.7 |
/common/OpenMPI |
OpenMPI |
4.1.1 |
/usr/local/modulefiles |
数値計算ライブラリ
ライブラリ |
バージョン |
リンク可能なコンパイラ |
Intel Math Kernel Library (MKL) |
2025.0 |
Intelコンパイラ |
AMD Optimizing CPU Libraries (AOCL) |
5.0 |
AOCC |
Singularityコンテナ
科学計算用コンテナ名称 |
ソフトウェア名称 |
バージョン |
prg_env_amd_2025.01 |
Radeon Open Compute (ROCm) |
6.3.3 |
Python |
3.13.2 |
|
Perl |
5.40.2 |
|
Ruby |
3.4.1 |
|
prg_env_intel_2025.01 |
CUDA |
12.8 |
Python |
3.13.2 |
|
Perl |
5.40.2 |
|
Ruby |
3.4.1 |
- コンテナは適宜バージョンアップアップされます．/common/Singularity_sifにイメージファイルがありますので，適宜確認いただき最新のものをご利用ください．
ユーザが用意したコンテナを使用することもできます．詳しくは Singularityイメージファイルの入手 を参照してください．
アプリケーション
窓口サーバ用アプリケーション
名称 |
バージョン |
説明 |
Emacs |
27.2 |
エディタ |
Visual Studio Code |
1.97.2 |
エディタ |
Perl |
5.32 |
プログラミング言語 |
Python |
3.12.5 |
プログラミング言語 |
Ruby |
3.0.7p220 |
プログラミング言語 |
Eigen |
3.4.0 |
行列ベクトル演算ライブラリ |
OpenJDK |
1.8.0_442 |
Java開発環境 |
MATLAB |
R2024b |
数値計算ソフトウェア |
Google Chrome |
133 |
Webブラウザ |
Mozilla Firefox |
18.7.0 |
Webブラウザ |
Evince |
40.5 |
PDFビューワ |
Libre Office |
5.3.6.1 |
Officeソフトウェア |
TeX Live 2020 |
3.14159265 |
組版処理ソフトウェア |
gnuplot |
5.4 |
グラフ作成 |
tgif |
4.2 |
作図ツール |
inkspace |
1.1 |
作図ツール |
dia |
0.97.3 |
ダイアグラム作成 |
Gimp |
2.99.8 |
画像編集 |
Image Magick |
6.9.3.17-1 |
画像表示/変換 |
GTK+ |
4 |
GUIライブラリ |
Ghostscript |
9.54 |
日本語対応Post Script処理系 |
研究用アプリケーション
アプリケーション |
バージョン |
説明 |
インストールディレクトリ |
ABAQUS |
2025 |
汎用非線形有限要素解析プログラム |
/common/ABAQUS/2025 |
ANSYS HFSS |
2024r1 |
高周波3次元電磁界解析ソフトウェア |
/common/HFSS |
COMSOL Multiphysics |
6.3 |
有限要素法を用いた汎用物理シミュレーションソフトウェア |
/common/COMSOLMultiphysics |
Gaussian |
16 Rev.C.01 |
量子化学計算ソフトウェア |
/common/Gaussian |
Materials Studio |
2025 |
分子モデリング・シミュレーション |
/common/MaterialsStudio/MaterialsStudio25.1 |
- HPCクラスタにて研究目的で研究用アプリケーションを利用するには，計算機利用申込書の提出が必要です．
申請方法は こちら を参照してください．